La Maestría en Ciencias (Física Médica) tiene como objetivo formar expertos que desarrollen de una manera creativa, las labores en el ejercicio profesional de un físico médico clínico y/o, adquieran habilidades para realizar actividades de docencia y de investigación. El plan de estudios proporcionará: Los fundamentos físico-matemáticos y la base científica para la comprensión y ejecución de múltiples técnicas terapéuticas y de diagnóstico médico, basadas en principios y herramientas de la Física, que son utilizadas en la promoción y conservación de la salud del ser humano; la visión y la ética necesarias para la correcta aplicación de sus conocimientos en el ámbito médico; y la realización de labores de apoyo a la investigación

Las áreas que conforman el proyecto actual (aprobado en 2019) son:

• a) Física y dosimetría de la radioterapia;
• b) Física y dosimetría de las imágenes de diagnóstico médico que usan rayos X y radionúcleos;
• c) Física del uso de radiación no-ionizante en medicina;
• d) Aplicaciones de la física biológica en medicina;
• e) Instrumentación científica de uso médico;
• f) Otras aplicaciones de física en medicina.

Las actividades académicas del plan de estudios se organizan en cuatro grupos:

• i. Fundamentales de Física Médica: El alumno acreditará 61 créditos durante los dos primeros semestres, en nueve actividades académicas. La finalidad de estas actividades es introducir al alumno en los temas fundamentales de la Física Médica para con ello dotarlo de las herramientas necesarias que requiera la práctica profesional y para el desarrollo de su proyecto de investigación.
• ii. Integración: Se trata de la actividad académica obligatoria ubicada en el tercer semestre denominada Residencia Hospitalaria. Tiene como finalidad familiarizar al alumno con la parte aplicada y práctica de la metodología e instrumentación de uso corriente en hospitales de tercer nivel.
• iii. Aspectos técnico-metodológicos relacionados a la investigación que darán sustento al trabajo de tesis con el cual el alumno obtendrá el grado. El alumno deberá acreditar 8 créditos mediante la aprobación de las actividades académicas obligatorias: Seminarios de Investigación I y II, ubicadas en el tercer y cuarto semestre, respectivamente.
• iv. Complementario
  El propósito de profundizar en algún aspecto en la formación del alumno se da mediante mínimo una actividad académica optativa que puede cursarse durante el tercer o el cuarto semestre para que ésta sirva de complemento temático en el desarrollo del trabajo de graduación. El alumno deberá cubrir, al menos, un valor de seis créditos. Esta actividad también podrá ser acreditada en otros planes de estudios dentro o fuera de la UNAM. Los alumnos, de acuerdo con el procedimiento previsto para ello, podrán cubrir estos créditos aprobando actividades académicas de otros posgrados, o por la realización de actividades académicas en Laboratorios o instituciones de investigación o de Educación Superior Nacionales o Internacionales, con las que la UNAM tenga convenio.

El grado de Maestro en Ciencias (Física Médica) se obtiene después de completar un trabajo de Tesis o de publicar un artículo científico basado en su trabajo de Tesis. Ambas opciones requieren su defensa oral.